МБОУ СОШ № 16 является инновационной площадкой по введению ФГОС ООО с 2013 года презентация. Учреждение для себя выбрало направление по реализации проектной и исследовательской деятельности на тему «Учебно-исследовательская и проектная деятельность как одно из важнейших средств повышения мотивации и эффективности учебной деятельности». Проектная деятельность в МБОУ СОШ №16 осуществляется через урочную и внеурочную деятельность. Метод проектов активно реализуется учителями истории и обществознания, русского языка и литературы, биологии, технологии. В апреле 2016 года Касмынина И. А. , учитель биологии, приняла участие во Всероссийской акции «Хранители воды». Учащиеся пятых классов выставили в школе свои проектные работы, отчет о них был включен во Всероссийскую акцию. В 5-6 классахработает кружок «Юный музеевед» (руководитель Перепеличенко Г.В.).В феврале 2016 года кружок подготовил и представил проект «Рожденные в СССР», где обучающиеся совместными усилиями со взрослыми приносили в музейную комнату предметы быта, одежды времен СССР. Этот проект вызвал большой успех у обучающихся и выпускников МБОУ СОШ №16. В рамках инновационных идей и проектной деятельности учителями русского языка и литературы и обучающимися школы в декабре 2015 года была представлена проектная работа в виде крупного мероприятия в рамках окончания Года литературы « Литературный бал», в котором дети и учителя показали инсценирование знаменитых произведений А.С.Пушкина, И.С.Тургенева, современных писателей и устного народного творчества. Три год в школе работает кружок по робототехнике под руководством учителя начальных классов Кутняковой А.Ю. Ее обучающиеся стали лауреатами и призерами как краевых конкурсов «Робофест – Юг», «Робофест – Кубань», так и лауреатами Всероссийского. Кутнякова А.Ю. вместе со своими учениками делилась опытом в г. Сочи и в г. Москва.